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如何進行R代碼調試

發布時間:2021-12-08 15:04:21 來源:億速云 閱讀:412 作者:柒染 欄目:大數據

如何進行R代碼調試,相信很多沒有經驗的人對此束手無策,為此本文總結了問題出現的原因和解決方法,通過這篇文章希望你能解決這個問題。

R語言編程,簡單的R代碼調試,其實靠head,str,help函數即可。所以我從強調初學者應該是要至少把這3個函數敲1000遍以上。比如,群里有人問它的表達矩陣里面的探針ID,跟他準備好的探針ID與基因對應表格, 無法匹配,自己在Excel手動搜索,明明是每一個 探針都存在于準備好的探針ID與基因對應表格里面。

如何進行R代碼調試

探針ID與基因對應表格

我讓他把兩個數據保存為rdata給我,我寫代碼檢查了一下:

rm(list = ls())   
load('input.Rdata')
head(ids)
exprSet[1:4,1:4]
head(rownames(exprSet))
rownames(exprSet)=gsub('"','',rownames(exprSet))
head(rownames(exprSet))
 
其實我就是簡簡單單的使用了head函數,就調試出來了。
不過,也有高級調試工具debugging tools,比如一些   R中的調試函數  
  • traceback 函數
  • debug 函數
  • browser 函數
  • trace 函數
  • recover 函數
另外,很多開發者在編寫其R包的函數里面,也會加入3種用戶交互信息:
  • message:由message()函數產生
  • warning:由warning()函數產生
  • error:由stop()函數產生 

看完上述內容,你們掌握如何進行R代碼調試的方法了嗎?如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容,歡迎關注億速云行業資訊頻道,感謝各位的閱讀!

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