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lncRNA相關疾病數據庫lncrnadisease怎么理解

發布時間:2022-01-15 13:58:09 來源:億速云 閱讀:134 作者:柒染 欄目:大數據

這篇文章給大家介紹lncRNA相關疾病數據庫lncrnadisease怎么理解,內容非常詳細,感興趣的小伙伴們可以參考借鑒,希望對大家能有所幫助。

有研究表明,長鏈非編碼RNA和許多的生命活動,疾病相關聯,比如癌癥,心腦血管病,神經退行性疾病等,為了更好的研究lncRNA的功能,開發者收錄整理了已經報道的lncRNA和疾病的關聯,并整理成了數據庫lncrnadisease, 網址如下

http://www.cuilab.cn/lncrnadisease

最新版的數據庫中包含了914個lncRNA, 329種疾病, 將近3000個lncRNA與疾病之間的關聯信息,還包含了475個lncRNA與其他分子的相互作用信息。

通過Browser功能,可以根據lncRNA或者disease的名稱瀏覽相關記錄,以HOTAIR為例,結果示意如下

lncRNA相關疾病數據庫lncrnadisease怎么理解

對于lncRNA, 會給出名稱,染色體位置,物種,轉錄本編號,序列等基本信息,同時對于相關的疾病,會給出疾病名稱,文獻等信息。

除了lncRNA相關的疾病,該數據庫還提供了lncRNA和其他分子的相互作用信息,通過Interaction可以查看相互作用信息,以HOTAIR為例,結果示意如下

lncRNA相關疾病數據庫lncrnadisease怎么理解

根據相互作用的分子的類型,劃分了不同的互作類型,并給出了對應的文獻。

該數據庫中的數據是開放下載的,而且是txt或者xls格式的,非常的友好。

該數據庫其實就是一個文獻整理工作的總結,通過該數據庫,我們可以方便的得到已經報導的lncRNA相關疾病信息。

關于lncRNA相關疾病數據庫lncrnadisease怎么理解就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,可以學到更多知識。如果覺得文章不錯,可以把它分享出去讓更多的人看到。

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