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R語言中聚類函數的應用有哪些

發布時間:2022-01-20 10:39:39 來源:億速云 閱讀:143 作者:iii 欄目:開發技術

本篇內容介紹了“R語言中聚類函數的應用有哪些”的有關知識,在實際案例的操作過程中,不少人都會遇到這樣的困境,接下來就讓小編帶領大家學習一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細閱讀,能夠學有所成!

系統聚類Hierarchical clustering(層次聚類、譜系聚類)— 最短距離法(single linkage)— 最長距離法 (complete linkage)— 中間距離法 (median method)— 可變距離法 (flexible median)— 重心

系統聚類Hierarchical clustering(層次聚類、譜系聚類)
— 最短距離法(single linkage)
— 最長距離法 (complete linkage)
— 中間距離法 (median method)
— 可變距離法 (flexible median)
— 重心法 (centroid)
— 類平均法 (average)
— 可變類平均法 (flexible average)
— Ward 最小方差法 (Ward's minimum variance)

在生信行業中,經常會利用到上述聚類方法,對生物數據進行聚類分析,例如R 中常見的相關聚類函數的應用:hclust()參數method:

"single"    最短距離法
"complete"    最長距離法
"median"    中間距離法(=WPGMC)
"average"    類平均法(=UPGMA)
"centroid"    重心法(=UPGMC)
"ward"    離差平方和
"Mcquitty"    相似分析法 (=WPGMA)

需要注意,實際不同語言或不同函數具體的層次聚類方法或有差異,需多加探索。

“R語言中聚類函數的應用有哪些”的內容就介紹到這里了,感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業相關的知識可以關注億速云網站,小編將為大家輸出更多高質量的實用文章!

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