blast報錯怎么辦

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在剛開始按官網教程（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK279680/）學習使用blast時，經常會遇到程序報錯，例如：

直接復制粘貼官網的代碼并執行：

makeblastdb –in mydb.fsa –dbtype nucl –parse_seqids

總會有如下錯誤提示：

USAGE
  makeblastdb [-h] [-help] [-in input_file] [-input_type type]
    -dbtype molecule_type [-title database_title] [-parse_seqids]
    [-hash_index] [-mask_data mask_data_files] [-mask_id mask_algo_ids]
    [-mask_desc mask_algo_descriptions] [-gi_mask]
    [-gi_mask_name gi_based_mask_names] [-out database_name]
    [-max_file_sz number_of_bytes] [-logfile File_Name] [-taxid TaxID]
    [-taxid_map TaxIDMapFile] [-version]
DESCRIPTION
   Application to create BLAST databases, version 2.4.0+
Use '-help' to print detailed descriptions of command line arguments
========================================================================
Error: Too many positional arguments (1), the offending value: –in
Error:  (CArgException::eSynopsis) Too many positional arguments (1), the offending value: –in

多次修改嘗試，結果都是如此。直到有一次手動輸入命令時，才沒有報錯。仔細比對才發現官網命令和手動輸入命令的參數名稱前面的小橫杠有細微差異（官網：–，手工輸入：-）。所以，只需要修改橫杠即可。

因此不能直接粘貼官網的命令，需要手動修改命令的參數名稱前面的小橫杠哦~

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