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iTOL怎么為進化樹外層添加圓環

發布時間:2022-03-19 13:44:05 來源:億速云 閱讀:3360 作者:iii 欄目:開發技術

這篇“iTOL怎么為進化樹外層添加圓環”文章的知識點大部分人都不太理解,所以小編給大家總結了以下內容,內容詳細,步驟清晰,具有一定的借鑒價值,希望大家閱讀完這篇文章能有所收獲,下面我們一起來看看這篇“iTOL怎么為進化樹外層添加圓環”文章吧。

首先準備好進化樹。

然后準備注釋文件,其格式如下:

DATASET_COLORSTRIP
#lines starting with a hash are comments and ignored during parsing
#select the separator which is used to delimit the data below (TAB,SPACE or COMMA).This separator must be used throught this file (except in the SEPARATOR line, which uses space).
#SEPARATOR TAB
SEPARATOR SPACE
#SEPARATOR COMMA
#label is used in the legend table (can be changed later)
DATASET_LABEL color_strip2
#dataset color (can be changed later)
COLOR #ff0000
#optional settings
#all other optional settings can be set or changed later in the web interface (under 'Datasets' tab)
#maximum width
STRIP_WIDTH 25
#left margin, used to increase/decrease the spacing to the next dataset. Can be negative, causing datasets to overlap.
MARGIN 0
#border width; if set above 0, a black border of specified width (in pixels) will be drawn around the color strip 
BORDER_WIDTH 1
BORDER_COLOR #000
#show internal values; if set, values associated to internal nodes will be displayed even if these nodes are not collapsed. It could cause overlapping in the dataset display.
SHOW_INTERNAL 0
#In colored strip charts, each ID is associated to a color. Color can be specified in hexadecimal, RGB or RGBA notation
#Internal tree nodes can be specified using IDs directly, or using the 'last common ancestor' method described in iTOL help pages
#Actual data follows after the "DATA" keyword
DATA
#ID1 value1
#ID2 value2
160232 #efff22 COL#efff22
13773 #efff22 COL#efff22
56636 #efff22 COL#efff22
111955 #efff22 COL#efff22
2287 #efff22 COL#efff22
50339 #efff22 COL#efff22
2303 #efff22 COL#efff22
2234 #efff22 COL#efff22

DATA之前的部分都是格式聲明,照抄即可。之后就是添加圓環數據,數據分兩列,第一列為原始標簽,第二列是圓環對應顏色,之間以Ta空格分隔。準備好數據后就可以加到進化樹中了。

以上就是關于“iTOL怎么為進化樹外層添加圓環”這篇文章的內容,相信大家都有了一定的了解,希望小編分享的內容對大家有幫助,若想了解更多相關的知識內容,請關注億速云行業資訊頻道。

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