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WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

發布時間:2021-12-08 15:03:29 來源:億速云 閱讀:302 作者:柒染 欄目:大數據

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決,很多新手對此不是很清楚,為了幫助大家解決這個難題,下面小編將為大家詳細講解,有這方面需求的人可以來學習下,希望你能有所收獲。

“老米”投稿:手把手10分文章WGCNA復現:小膠質細胞亞群在腦發育時髓鞘形成的作用 , 里面是有TOM矩陣熱圖,就是配色很奇怪。所以經常有人詢問這個問題:

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

奇怪的配色

但是官網配色是:

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

官網配色

首先,這個差異其實并不重要,當然了這個TOM矩陣熱圖本身就可有可無,僅僅是因為教程里提到了而已,大部分情況下,就是湊圖。

再說,這個配色問題,跟WGCNA沒有關系,是R語言技巧罷了。或者說是搜索技巧:

  • https://www.biostars.org/p/394615/#394743

簡單的配色代碼即可解決:

TOMplot(plotTOM, geneTree, moduleColors, main = "Network heatmap plot, all genes", col=gplots::colorpanel(250,'red',"orange",'lemonchiffon')) 

看完上述內容是否對您有幫助呢?如果還想對相關知識有進一步的了解或閱讀更多相關文章,請關注億速云行業資訊頻道,感謝您對億速云的支持。

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