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r語言怎么進行單因素方差分析

發布時間:2022-05-19 15:30:10 來源:億速云 閱讀:324 作者:iii 欄目:大數據

這篇文章主要介紹“r語言怎么進行單因素方差分析”的相關知識,小編通過實際案例向大家展示操作過程,操作方法簡單快捷,實用性強,希望這篇“r語言怎么進行單因素方差分析”文章能幫助大家解決問題。

1, 導入軟件包和數據

library(agricolae)
data(sweetpotato)

2, 查看數據類型

可以看到, 數據為兩列, 第一列為不同病毒的類型, 第二列為產量, 為了研究不同病毒感染對產量的影響.

> head(sweetpotato)
 virus yield
1    cc  28.5
2    cc  21.7
3    cc  23.0
4    fc  14.9
5    fc  10.6
6    fc  13.1

3, 使用R語言建模

因素: virus
變量: yield

model<-aov(yield~virus, data=sweetpotato)
summary(model)

4, 方差分析結果:

可以看到不同病毒達到顯著性水平.

> summary(model)
           Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)
virus        3 1170.2   390.1   17.34 0.000733 ***
Residuals    8  179.9    22.5
---
Signif. codes:
0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

5, 多重比較:

這里多重比較采用LSD方法.

out <- LSD.test(model,"virus", p.adj="bonferroni")
out$groups

結果可以看到, oo, ff,cc之間不顯著(都有a), oo,ff與fc之間顯著(字母沒有交集).

> out$groups
     yield groups
oo 36.90000      a
ff 36.33333      a
cc 24.40000     ab
fc 12.86667      b

6, 多重比較作圖

plot(out)

r語言怎么進行單因素方差分析

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