Java MessageDigest 類提供了消息摘要功能，用于生成數據的固定長度的唯一表示。為了提高安全性，您可以采取以下措施：

1. 使用更安全的算法：MessageDigest 類支持多種哈希算法，如 MD5、SHA-1、SHA-256 等。建議使用 SHA-256 或 SHA-3，因為它們比 MD5 和 SHA-1 更安全，更難以遭受碰撞攻擊。

MessageDigest md = MessageDigest.getInstance("SHA-256");

2. 使用隨機鹽值：為了提高密碼存儲的安全性，可以在計算消息摘要之前為每個輸入數據添加一個隨機生成的鹽值（salt）。這樣即使兩個用戶使用相同的密碼，它們的哈希值也會不同。在驗證密碼時，需要使用相同的鹽值重新計算哈希值并進行比較。

byte[] salt = new byte[16];
SecureRandom random = new SecureRandom();
random.nextBytes(salt);

MessageDigest md = MessageDigest.getInstance("SHA-256");
md.update(salt);
byte[] hashedPassword = md.digest(password.getBytes());

3. 使用密鑰派生函數（KDF）：密鑰派生函數（如 PBKDF2、bcrypt 或 scrypt）可以將密碼轉換為固定長度的哈希值。這些函數通常比簡單的哈希算法更安全，因為它們需要更多的計算資源和時間。

// 使用 PBKDF2
SecretKeyFactory skf = SecretKeyFactory.getInstance("PBKDF2WithHmacSHA256");
KeySpec spec = new PBEKeySpec(password.toCharArray(), salt, 10000, 256);
SecretKey key = skf.generateSecret(spec);

4. 更新 Java 運行時環境：確保您的 Java 運行時環境是最新的，因為舊版本可能存在已知的安全漏洞。

5. 限制輸入數據的長度：為了防止緩沖區溢出攻擊，可以限制輸入數據的長度。例如，當使用 SHA-256 時，輸入數據的長度不應超過 2^64 位。

6. 使用安全的編程實踐：遵循安全的編程實踐，如避免使用不安全的函數、驗證輸入數據、處理異常等，以確保應用程序的安全性。