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MyBatis連接池的核心難題主要包括以下幾個方面：
連接池大小的調優：連接池的大小直接影響著系統的性能和穩定性，如果連接池過小會導致頻繁的連接創建和銷毀，影響系統性能；如果連接池過大會占用過多的系統資源，導致系統崩潰。因此，如何合理地設置連接池的大小是一個難題。
連接的有效性檢測：連接池中的連接可能因為網絡故障或數據庫問題而失效，需要定期檢測連接的有效性，及時將失效的連接移除并重新創建新的連接。但是有效性檢測會增加系統開銷，影響系統性能，如何平衡有效性檢測的頻率和系統性能是一個難題。
連接的超時管理：連接在使用過程中可能會發生超時，如果不及時釋放會導致資源泄露，影響系統的穩定性。因此，需要設置連接的超時管理策略，及時釋放超時的連接。但是過于頻繁的超時檢測也會影響系統性能，如何合理地設置超時管理策略是一個難題。
連接的回收和重用：連接使用完畢后需要及時回收并放回連接池中供其他線程重用，但是連接的回收和重用過程可能會出現資源競爭和線程安全問題，如何保證連接的回收和重用的線程安全性是一個難題。
綜上所述，MyBatis連接池的核心難題主要包括連接池大小的調優、連接的有效性檢測、連接的超時管理和連接的回收和重用等方面。解決這些難題需要綜合考慮系統的性能、穩定性和資源消耗等因素，做到合理平衡。
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