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虛擬機中如何快速獲取多條序列長度信息

發布時間:2022-03-10 11:01:24 來源:億速云 閱讀:306 作者:小新 欄目:開發技術

這篇文章主要介紹了虛擬機中如何快速獲取多條序列長度信息,具有一定借鑒價值,感興趣的朋友可以參考下,希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲,下面讓小編帶著大家一起了解一下。

如何快速知道你的多個序列的長度呢?這里還是分享一個虛擬機的bio-linux的工具,samtools。命令行格式:samtools faidx   xulie.fa(你的序列文件)結果會生成一個 xulie.fa.fai文件,也是就是在你的序列文件名后面多了一個fai,文件合適如下:

211000022280750 9865 142631474 60 61
211000022280526 9368 142641578 60 61
211000022279869 9341 142651177 60 61
211000022278215 8346 142660748 60 61
211000022279695 8007 142669308 60 61
211000022279735 7722 142677523 60 61
211000022280490 7314 142685448 60 61
211000022280465 7123 142692958 60 61
211000022280734 7003 142700274 60 61
211000022278032 6936 142707468 60 61
211000022280476 6900 142714594 60 61
211000022280735 6860 142721683 60 61
211000022279018 6860 142728732 60 61
211000022280699 6825 142735781 60 61

感謝你能夠認真閱讀完這篇文章,希望小編分享的“虛擬機中如何快速獲取多條序列長度信息”這篇文章對大家有幫助,同時也希望大家多多支持億速云,關注億速云行業資訊頻道,更多相關知識等著你來學習!

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