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小編給大家分享一下如何使用awk篩選差異基因，相信大部分人都還不怎么了解，因此分享這篇文章給大家參考一下，希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲，下面讓我們一起去了解一下吧！
命令行篩選差異基因
將圖片拖文件格式：
ID log2fc FDR gene1 1 0.001 gene2 -1 0.001 gene3 1 0.001 gene4 2 0.0001
篩選條件：log2fc的絕對值大于1，FDR<0.05
命令：
awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"}{if(FNR==1) print $0; else {abs_log2fc=($2<0?$2*(-1):$2);if(abs_log2fc>=1 && $3<0.05) print $0;}}' de_gene.txt$2代表的是第二列的log2fc,你的文件的log2fc在哪一列就用$第幾列，$3代表FDR，你的文件第幾列是也是寫$第幾列
篩選差異基因存儲到不同的文件
命令：
awk 'BEGIN{OFS=FS="\t"; up="up"; dw="dw";}{if(FNR==1) {print $0 >up; print $0 >dw;} else if ($3<0.05) {if ($2>=1) print $0 >up; else if($2<=-1) print $0 >dw;}}' de_gene.txt以上是“如何使用awk篩選差異基因”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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