VennDiagram各區域信息提取的示例分析

這篇文章主要為大家展示了“VennDiagram各區域信息提取的示例分析”，內容簡而易懂，條理清晰，希望能夠幫助大家解決疑惑，下面讓小編帶領大家一起研究并學習一下“VennDiagram各區域信息提取的示例分析”這篇文章吧。

VennDiagram是進行Venn圖繪制的 R包，最多能夠繪制五組數據，其中一個主要的繪圖函數為venn.diagram()

針對該參數相關的參數調整，可以直接對Venn圖的顏色字體等多主題進行修改。而其繪圖數據，也就是venn.diagram() 對應的數據是一個list向量，

數據的讀取和整理可以參考：

R語言繪制維恩圖空值NA處理：https://www.億速云.com/article/259 數據讀取方式，

1、譬如經相似讀取數據和處理之后，獲取一個向量xList，數據基本情況如下：

summary(xList)
        Length Class  Mode     
AT_4000 4000   -none- character
AT_3892 3892   -none- character
AT_3593 3593   -none- character
AT_3000 3000   -none- character
AT_2987 2987   -none- character

一共五組數據，各組數據如上所示，venn.diagram()繪圖：

venn.plot =venn.diagram(xList,filename = NULL)

grid.newpage()
grid.draw(venn.plot)

之后基于相關代碼調整即可。

2 如何獲取各區域信息是繪制Venn圖的一個關鍵問題

可以基于VennDiagram提供的計算函數 calculate.overlap 或者get.venn.partitions

以前者為例：

area=calculate.overlap(xList)
> typeof(area)
[1] "list"
> summary(area)
    Length Class  Mode     
a31 220    -none- character
a30 286    -none- character
a29 285    -none- character
a28 175    -none- character
a27 178    -none- character
a26 149    -none- character
a25 136    -none- character
a24 206    -none- character
a23 232    -none- character
a22 356    -none- character
a21 217    -none- character
a20 284    -none- character
a19 255    -none- character
a18 147    -none- character
a17 204    -none- character
a16 131    -none- character
a15 123    -none- character
a14 213    -none- character
a13 187    -none- character
a12 300    -none- character
a11 278    -none- character
a10 216    -none- character
a9  392    -none- character
a8  209    -none- character
a7  204    -none- character
a6  153    -none- character
a5  165    -none- character
a4  153    -none- character
a3  211    -none- character
a2  224    -none- character
a1  273    -none- character

如上結果顯示 五組一共獲得31各區域的數據，可以利用返回的list提取每一個區域的結果，譬如取出a1區域（共273）的前10個：

> area$a1[1:10]
 [1] "AT3G27960" "AT4G12170" "AT1G58270" "AT3G55290" "AT1G27360" "AT2G02790" "AT1G42990" "AT3G25011"
 [9] "AT2G24617" "AT5G55910"

以上是“VennDiagram各區域信息提取的示例分析”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！