您好,登錄后才能下訂單哦!
小編給大家分享一下如何采用biopython計算蛋白質的等電點,希望大家閱讀完這篇文章之后都有所收獲,下面讓我們一起去探討吧!
采用biopython 計算蛋白質的等電點
最近在做一些蛋白質組的項目,項目中需要計算蛋白質的等電點。網絡上有很多網站能提供相應計算服務,但是都是針對單條蛋白質序列進行計算,而我需要計算蛋白質組中所有蛋白序列的等電點。采用Bioython中的幾個函數進行計算,代碼如下:
from Bio.SeqUtils.ProtParam import ProteinAnalysis from Bio import SeqIO # 指定蛋白序列的fasta文件 protein_file = "protein.fasta" # 遍歷每一條蛋白序列,計算等電點 for seq_record in SeqIO.parse(protein_file, "fasta"): p = ProteinAnalysis(str(seq_record.seq)) # 等電點的計算函數是:isoelectric_point print(seq_record.id + '\t' + str(p.isoelectric_point()))
看完了這篇文章,相信你對“如何采用biopython計算蛋白質的等電點”有了一定的了解,如果想了解更多相關知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道,感謝各位的閱讀!
免責聲明:本站發布的內容(圖片、視頻和文字)以原創、轉載和分享為主,文章觀點不代表本網站立場,如果涉及侵權請聯系站長郵箱:is@yisu.com進行舉報,并提供相關證據,一經查實,將立刻刪除涉嫌侵權內容。