您好,登錄后才能下訂單哦!
這篇文章主要介紹了blastall中的文件格式有哪些的相關知識,內容詳細易懂,操作簡單快捷,具有一定借鑒價值,相信大家閱讀完這篇blastall中的文件格式有哪些文章都會有所收獲,下面我們一起來看看吧。
1、Query id:查詢序列ID標識
2、Subject id:比對上的目標序列ID標識
3、% identity:序列比對的一致性百分比
4、alignment length:符合比對的比對區域的長度
5、mismatches:比對區域的錯配數
6、gap openings:比對區域的gap數目
7、q. start:比對區域在查詢序列(Query id)上的起始位點
8、q. end:比對區域在查詢序列(Query id)上的終止位點
9、s. start:比對區域在目標序列(Subject id)上的起始位點
10、s. end:比對區域在目標序列(Subject id)上的終止位點
11、e-value:比對結果的期望值,解釋是大概多少次隨即比對才能出現一次這個score,Evalue越小,表明這種情況從概率上越不可能發生,那么發生了即說明這更有可能是真實的相似序列
12、bit score:比對結果的bit score值
一般情況我們看第3、11、12兩列,e值越小越可靠。
blast對應的參數是 -m 8
blast+對應的參數是-outfmt 6
關于“blastall中的文件格式有哪些”這篇文章的內容就介紹到這里,感謝各位的閱讀!相信大家對“blastall中的文件格式有哪些”知識都有一定的了解,大家如果還想學習更多知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道。
免責聲明:本站發布的內容(圖片、視頻和文字)以原創、轉載和分享為主,文章觀點不代表本網站立場,如果涉及侵權請聯系站長郵箱:is@yisu.com進行舉報,并提供相關證據,一經查實,將立刻刪除涉嫌侵權內容。