miRNA合成及miRNA命名的方法

本篇內容介紹了“miRNA合成及miRNA命名的方法”的有關知識，在實際案例的操作過程中，不少人都會遇到這樣的困境，接下來就讓小編帶領大家學習一下如何處理這些情況吧！希望大家仔細閱讀，能夠學有所成！

miRNA合成過程，以及miRNA命名方式，編號規則

        MicroRNA （miRNA） 是一類內生的、長度約為20-24個核苷酸的小RNA，其在細胞內具有多種重要的調節作用。每個miRNA可以有多個靶基因，而幾個miRNA也可以調節同一個基因。這種復雜的調節網絡既可以通過一個miRNA來調控多個基因的表達，也可以通過幾個miRNA的組合來精細調控某個基因的表達。據推測，miRNA調節著人類三分之一的基因。最近的研究表明大約70 %的哺乳動物miRNA 是位于TUs區( transcriptionunits , TUs )  , 且其中大部分是位于內含子區 。一些內含子miRNA 的位置在不同的物種中是高度保守的。miRNA 不僅在基因位置上保守, 序列上也呈現出高度的同源性 。miRNA 高度的保守性與其功能的重要性有著密切的關系。miRNA 與其靶基因的進化有著密切的聯系, 研究其進化歷史有助于進一步了解其作用機制和功能。

miRNA的生物合成

miRNA是一種小的、內源性的、長度為20-24個核苷酸的單鏈RNA，由發夾狀初始轉錄產物經過加工后形成，它的序列存在于發夾狀莖環結構中的莖上。

在動物中，miRNA基因在RNA聚合酶II的作用下轉錄生成miRNA初級轉錄產物primary miRNA（pri-miRNA），pri-miRNA在細胞核內被Drosha蛋白加工為miRNA前體precursor miRNA（pre-miRNA），pre-miRNA在exportin-5的介導下運輸到胞漿，在細胞質中進一步由dicer酶加工為成熟的miRNA。

miRNA的5p和3p

     有的miRNA前體兩個臂分別產生一條有功能的成熟miRNA，他們分別靶向不同的位點。這時候就要來進行區分，一般以“-5p”和“-3p”分別命名。如hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p，分別表明從hsa-mir-21前體的5’端臂和3’端臂加工而來的。

miRNA命名

1) miRNA成熟體命名規則(以動物miRNA為例：

    ①確定命名規則之前發現的miRNA，則保留原來名字，如hsa-let-7

    ②miRNA成熟體簡寫成miR，再根據其物種名稱，及被發現的先后順序加上阿拉伯數字，如hsa-miR-122

    ③高度同源的miRNA在數字后機上英文小寫字母(a,b,c,…)，如hsa-miR-34a，hsa-miR-34b，hsa-miR-34c等

    ④由不同染色體上的DNA序列轉錄加工而成的具有相同成熟體序列的miRNA，則在后面機上阿拉伯數字以示區分，如hsa-miR-199a-1和hsa-miR-199a-2

    ⑤通常一個miRNA前體長度大約為70~80nt，很可能兩個臂分別產生miRNA：如果沒有明顯的表達差異，則以“-5p”和“-3p”分別命名。如hsa-miR-26b-5p和hsa-miR-26b-3p，分別表明從hsa-mir-26b前體的5’端臂和3’端臂加工而來的

2）miRNA編號

① miRNA前體

    發夾狀結構的miRNA前體轉錄本以“mir”命名，其編號以“MI”編號，如人的miRNA 122的前體ID為hsa-mir-122，Accession為MI0000442

② miRNA成熟體
    大約20～23nt的miRNA成熟體以“miR”命名，其編號以“MIMAT”編號，如人的miR-122有兩個成熟體，其中之一ID為hsa-miR-122-5p ，Accession為 MIMAT0000421;另一個為ID為hsa-miR-122-3p ，Accession為 MIMAT000 4590

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