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Rcpp和RcppArmadillo如何創建R語言包

發布時間:2021-11-06 17:20:23 來源:億速云 閱讀:190 作者:小新 欄目:開發技術

小編給大家分享一下Rcpp和RcppArmadillo如何創建R語言包,相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!

    1. 預先準備

    Windows下需要安裝Rtools,R中裝好Rcpp和RcppArmadillo。創建C++源文件func.cpp,自定義頭文件test_h.h

    源文件示例func.cpp

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
    #include <RcppArmadillo.h>
    #include <vector>
    #include "./test_h.h"
    
    using namespace Rcpp;
    using namespace std;
    // using namespace arma;
    
    // [[Rcpp::export]]
    RObject func(){
      arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);
      std::cout<<CONDIT<<std::endl;
      return wrap(A);
    }

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]:用于指明需要使用RcppArmadillo。

    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用C++11。

    #include "./test_h.h":表示使用第三方頭文件。第三方頭文件需要用雙引號""包括起來,并加上.h./表示在當下文件夾(src)下搜尋文件。

    // using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的數據結構,在其之前需指明arma::

    func()函數將可以直接在R中調用。

    頭文件示例test_h.h

     

    #include <iostream>
    #define CONDIT 1000

    2. 創建R包步驟

    新建R Package

    Rcpp和RcppArmadillo如何創建R語言包

    選擇Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手動復制到src文件夾下。

    Rcpp和RcppArmadillo如何創建R語言包

    R包的文件結構

    Rcpp和RcppArmadillo如何創建R語言包

    修改DESCRIPTION文件

    將RcppArmadillo添加進Imports和LinkingTo中。

    Package: RcppPackTest
    Type: Package
    Title: What the Package Does (Title Case)
    Version: 0.1.0
    Author: Who wrote it
    Maintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>
    Description: More about what it does (maybe more than one line)
        Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.
    License: What license is it under?
    Encoding: UTF-8
    LazyData: true
    Imports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadillo
    LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

    Build & Reload 建立包

    3. C++11標準問題

    如果要使用C++11標準,第一種方法是在Makevars文件中添加如下代碼:

    CXX = g++-4.8.1
    PKG_CXXFLAGS = -std=c++11

    第二種方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

    以上是“Rcpp和RcppArmadillo如何創建R語言包”這篇文章的所有內容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內容對大家有所幫助,如果還想學習更多知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道!

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