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小編給大家分享一下如何利用R語言的ggplot2包繪制箱線圖，希望大家閱讀完這篇文章之后都有所收獲，下面讓我們一起去探討吧！
一 繪制基本的箱線圖
載入數據及函數包
library(ggplot2)library(RColorBrewer)
dose數值 變成因子變量
ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose) head(ToothGrowth) #查看數據集 len supp dose1 4.2 VC 0.52 11.5 VC 0.53 7.3 VC 0.54 5.8 VC 0.55 6.4 VC 0.56 10.0 VC 0.5
1）geom_boxplot繪制基本的箱線圖
使用ToothGrowth數據集，dose變量為分類橫坐標，對len變量做箱線圖
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot()
旋轉箱線圖方向并設置notch
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(notch=TRUE) + coord_flip()
2）修改異常點的屬性
設置outlier的 color, shape and size
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(outlier.colour="red", outlier.shape=18,outlier.size=4)
此外， outlier.fill：離群點的填充色；outlier.alpha：離群點的透明度
3）選擇變量，設定順序
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot() + stat_summary(fun.y=mean, geom="point", shape=23, size=4, col = "red") + #添加均值scale_x_discrete(limits=c("2", "0.5")) #選擇變量，更改順序
4）添加最大值和最小值的兩條須線
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.15) + #添加虛線geom_boxplot()
5)箱線圖添加點
geom_point函數，向箱線圖中添加點；
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot() + geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', dotsize=1, binwidth = 1)
geom_jitter()函數是geom_point(position = "jitter")的包裝，binaxis="y"是指沿著y軸進行分箱；
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot() + geom_jitter(shape=16, position=position_jitter(0.2))
二 顏色設置
aes(color=)函數為每個箱線圖設置一個顏色，劃分箱線圖之后，可以使用scale_color_*()函數自定義顏色。
1)分組更改箱線的顏色
p<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, color=dose)) + geom_boxplot()p
自定義顏色方案
# Use custom color palettesp+scale_color_manual(values=c("#999999", "#E69F00", "skyblue"))# Use brewer color palettesp+scale_color_brewer(palette="Set3")+ theme_classic()# Use grey scalep + scale_color_grey() + theme_classic()
2)更改箱子填充顏色
fill 填充色 ； color 箱線的外框顏色
#單組 設置顏色
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len)) + geom_boxplot(fill='#A4A4A4', color="black")+ theme_classic()
#分組 設置顏色 ， 自定義顏色設置方案同上
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, fill=dose)) + geom_boxplot() + scale_fill_brewer(palette="Dark2") + theme_classic()
三 圖例，標題設置
1）設置legeng
Legend是對箱線圖的解釋性描述，默認的位置是在畫布的右側中間位置，可以通過theme()函數修改Legend的位置
p + theme(legend.position="top")p + theme(legend.position="bottom")p + theme(legend.position="none") # Remove legend
2）labs設置標題及坐標標簽
p+theme(legend.position="bottom") + labs(title="Plot of length per dose",x="Dose (mg)", y = "Length")
3）其他theme詳細設置可參考ggplot2-theme（主題）以及ggplot2-圖形微調（1）
四 箱線圖匯總展示
ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, fill=dose)) + stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.15)+ geom_boxplot()+ geom_dotplot(binaxis='y', stackdir='center', dotsize=0.5, binwidth = 1)+ labs(title="Plot of length per dose",x="Dose (mg)", y = "Length")+ scale_fill_manual(values=c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9")) + theme(legend.position="none")+ theme_minimal()
看完了這篇文章，相信你對“如何利用R語言的ggplot2包繪制箱線圖”有了一定的了解，如果想了解更多相關知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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