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這篇文章將為大家詳細講解有關plantcircbase數據庫有什么用，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。
plantcircBase是一個植物環狀RNA的數據庫，網址如下
http://ibi.zju.edu.cn/plantcircbase/index.php
該數據庫包含了以下13個物種的環狀RNA信息
Arabidopsis thaliana
Gossypium arboretum
Gossypium hirsutum
Glycine max
Gossypium raimondii
Hordeum vulgare
Oryza sativa
Poncirus trifoliata
Solanum lycopersicum
Solanum tuberosum
Triticum aestivum
Tea tree
Zea mays
收錄了來自這13個物種共98317個環狀RNA，利用物種對應的RNA_seq數據，采用了多款生物信息學軟件進行預測，以擬南芥為例，每款軟件預測的環狀RNA數量如下
通過導航欄的Browse菜單，可以瀏覽不同物種環狀RNA的記錄，示意如下
擬南芥共收錄了4916個環狀RNA,結果示意如下
點擊環狀RNA的name,可以查看詳細信息，示意如下
通過導航欄的Visualize菜單，可以通過可視化的方式查看環狀RNA的結構，示意如下
除了染色體位置，來源基因，序列等基本信息外，該數據庫還提供了circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA調控網絡信息，通過菜單欄的Network菜單，可以查看特定環狀RNA的調控網絡，結果示意如下
關于“plantcircbase數據庫有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，使各位可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，請把它分享出去讓更多的人看到。
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