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GtRNAdb:tRNA數據的示例分析，相信很多沒有經驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。
GtRNAdb收錄了不同物種的tRNA序列信息，這些tRNA都是通過tRNAscan-SE 2.0軟件預測得到，官網如下
http://gtrnadb.ucsc.edu/
最新版本收錄了超過4300個物種的tRNA序列，詳細統計信息如下
通過該網站，我們可以檢索物種對應的tRNA結果，也可以進行BLAST比對。
支持通過物種進行檢索，根據進化關系，篩選感興趣的物種，鏈接如下
http://gtrnadb.ucsc.edu/browse.html
點擊三角符號展開，然后篩選相應的次級分類即可。以hg38為例，檢索結果鏈接如下
http://gtrnadb.ucsc.edu/genomes/eukaryota/Hsapi38/
通過左側的菜單欄，可以詳細查看對應的信息。通過FASTA Seqs菜單，可以下載tRNA序列。
通過比對tRNA數據庫，確定輸入序列類型，鏈接如下
http://gtrnadb.ucsc.edu/blast.html
需要注意的是，在某些物種中，存在由tRNA衍生出來的重復序列，這些序列一級結構與tRNA非常接近，所以在tRNAscan-SE的預測結果中，會存在部分假陽性結果。GtRNAdb利用特定算法，對tRNAscan-SE直接預測的結果進行了一個過濾，降低了假陽性率。
對于數據庫中已知的物種，建議直接利用數據庫中的序列就好；對于數據庫中沒有的物種，再直接用tRNAscan-SE 進行預測。
看完上述內容，你們掌握GtRNAdb:tRNA數據的示例分析的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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