溫馨提示×
您好，登錄后才能下訂單哦！
點擊 登錄注冊 即表示同意《億速云用戶服務條款》
您好，登錄后才能下訂單哦！
這篇文章主要介紹ITK-SNAP實現摳圖操作并保存mask的方法，文中示例代碼介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！
問題描述：
想要去掉圖像背景,只保留中心部分
目標：
1.利用ITK-SNAP制作二值化標簽(即mask)
2.利用軟件ITK-SNAP把一幅圖像中自己想要的部分摳出來
步驟:
1.保存mask
打開ITK-SNAP ,這是一款可以方便進行勾畫操作,制作標簽的軟件
1.點擊勾畫按鈕
2.在圖像中選點進行勾畫
3.勾畫完成后點擊accept,可以看到所勾畫的區域被標簽顏色所覆蓋
4.滾動鼠標滾輪到下一層(對于3D圖像),繼續勾畫
tips:點擊"paste last polygon"按鈕使用上一層的勾畫結果,拖動勾畫框可以進行修改
5.勾畫完成后按ctrl+S保存圖像,此時所保存的即為二值化的mask(標簽)
2.提取目標區域（摳圖）
思想：將保存的二值化mask與原圖像做點乘，就可以將去除無關背景，得到中心區域的目標圖像
方法：（對于nii格式的圖像）
import nibabel as nib
import numpy as np
index = list(['1','14','4','5','7','70','148'])#一共7張待處理圖像
for i in range (len(index)):
#圖像位置
nii_file = '/home/YinXiaolong/1909/MRBrainS18_data/training_corrected_selected/'+index[i]+'/data/reg_IR.nii.gz'
nii_file2 = '/home/YinXiaolong/1910/mask_multiple/mask/' +'mask'+ index[i]+ '.nii.gz'
#載入圖像
img = nib.load(nii_file).get_fdata()
img2 = nib.load(nii_file2).get_fdata()
#兩幅圖像相乘
img3 = np.multiply(img,img2)
#將矩陣轉換為nii
array_img = nib.Nifti1Image(img3,None)
#保存并導出
nib.save(array_img, 'reg_IR'+'_'+index[i]+'.nii')
print('img'+index[i]+'Done')對于一般格式圖像利用numpy中的img = np.multiply(img1,img2)進行兩幅圖像的點乘即可。
以上是ITK-SNAP實現摳圖操作并保存mask的方法的所有內容，感謝各位的閱讀！希望分享的內容對大家有幫助，更多相關知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
免責聲明：本站發布的內容（圖片、視頻和文字）以原創、轉載和分享為主，文章觀點不代表本網站立場，如果涉及侵權請聯系站長郵箱：is@yisu.com進行舉報，并提供相關證據，一經查實，將立刻刪除涉嫌侵權內容。
