日本服務器搭建網站保證數據安全的方法有：1、定期安裝補丁和更新服務器系統，以此減少漏洞帶來的安全風險；2、定期檢查服務器的硬盤，以確保網站數據庫的數據安全；3、定期檢查服務器的日志，以此避免或減少損失；4、有針對性安裝可靠的服務器軟件，以確保數據的安全性及完整性；5、選擇合適的日本服務器租用服務商，確保服務器出現故障時能夠及時解決。
具體內容如下：
1、定期安裝補丁與系統更新
由于服務器上并非所有軟件或系統都能自動升級或更新，為了提高軟件的安全性、易用性、減少漏洞帶來的安全風險，需要運營人員定期對服務器系統進行檢測、修補和更新。此外開發團隊在業務搭建過程中難以測試每一個軟件與硬件的兼容性，也不能測試補丁、更新潛在的問題，因此軟件更新會帶來更多的問題。因此，更新之前需要在沙盒環境中測試所有的補丁或更新。并做好評估，確保升級之后還可以回滾至舊版本。
2、定期檢查本地硬盤
由于硬盤為服務器提供支持，承載工作負荷，存儲用戶數據等功能。若硬盤介質出現故障，將嚴重影響負載性能和穩定性。要定期檢查硬盤，及時發現問題并進行分析修復，以保證硬盤正常運行。如果數據比較重要的話，最好是做raid架構進行備份確保網站數據庫數據的安全性和冗余。
3、定期檢查服務器日志
我們可以看到來自服務器事件日志的大量信息，如惡意軟件日志、系統日志等，從日志中我們可以看到服務器存在什么問題，是否有受到攻擊的跡象等等，及時發現問題，快速分析和解決，可以避免或減少損失。
4、安裝可靠的服務器軟件
在搭建服務器的時候除了內部安全設置還需要，安裝必要的安全軟件，此外還需要養成定期備份的習慣，這樣才能夠確保數據的安全性和完整性。
5、選擇合適的服務商
租用日本服務器的時候選擇合適的服務商非常重要，雖然日本機房的服務普遍都是比較可靠，但是并不是所有機房都是24小時在線的，所以在租用的時候最好選擇這些機房服務商，以免出現故障無法第一時間解決。
