在Java中配置多數據源可以通過以下步驟進行：

1. 導入相關的依賴包，如`spring-boot-starter-jdbc`、`druid`等。

2. 在`application.properties`或`application.yml`文件中配置多個數據源的連接信息，如下所示：

  ```yaml
  spring:
    datasource:
      primary:
        url: jdbc:mysql://localhost:3306/primarydb
        username: root
        password: password
      secondary:
        url: jdbc:mysql://localhost:3306/secondarydb
        username: root
        password: password
  ```

3. 創建多個數據源對象，并配置到`DataSource`上下文中，如下所示：

  ```java
  @Configuration
  public class DataSourceConfig {
 
      @Primary
      @Bean(name = "primaryDataSource")
      @ConfigurationProperties(prefix = "spring.datasource.primary")
      public DataSource primaryDataSource() {
          return DataSourceBuilder.create().build();
      }
 
      @Bean(name = "secondaryDataSource")
      @ConfigurationProperties(prefix = "spring.datasource.secondary")
      public DataSource secondaryDataSource() {
          return DataSourceBuilder.create().build();
      }
  }
  ```

4. 在具體的數據訪問層或服務層中使用`@Qualifier`注解指定要使用的數據源，如下所示：

  ```java
  @Repository
  public class UserRepository {
 
      @Autowired
      @Qualifier("primaryDataSource")
      private DataSource primaryDataSource;
 
      @Autowired
      @Qualifier("secondaryDataSource")
      private DataSource secondaryDataSource;
 
      // 使用primaryDataSource進行數據庫操作
      // ...
 
      // 使用secondaryDataSource進行數據庫操作
      // ...
  }
  ```

5. 在Spring Boot的啟動類上添加`@EnableTransactionManagement`注解，啟用事務管理功能。

通過以上步驟，你就可以在Java中配置多數據源，并在不同的數據訪問層或服務層中使用不同的數據源進行數據庫操作了。