在Java中，獲取文件的MD5值的方法主要有以下幾種：

1. 使用java.security.MessageDigest類：可以使用MessageDigest類提供的getInstance(“MD5”)方法獲取MD5算法的實例，然后通過update()方法更新數據，最后通過digest()方法獲取摘要值。

import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;
import java.security.MessageDigest;
import java.security.NoSuchAlgorithmException;
public class FileMD5 {
public static String getFileMD5(File file) throws NoSuchAlgorithmException, IOException {
MessageDigest md5Digest = MessageDigest.getInstance("MD5");
FileInputStream fis = new FileInputStream(file);
byte[] buffer = new byte[8192];
int length;
while ((length = fis.read(buffer)) != -1) {
md5Digest.update(buffer, 0, length);
}
fis.close();
byte[] digest = md5Digest.digest();
StringBuilder sb = new StringBuilder();
for (byte b : digest) {
sb.append(String.format("%02x", b));
}
return sb.toString();
}
}

2. 使用Apache Commons Codec庫：Apache Commons Codec庫提供了DigestUtils類，其中包含了獲取MD5值的靜態方法md5Hex()。

import org.apache.commons.codec.digest.DigestUtils;
public class FileMD5 {
public static String getFileMD5(File file) throws IOException {
return DigestUtils.md5Hex(new FileInputStream(file));
}
}

3. 使用Java 7的NIO包：Java 7的NIO包中提供了獲取文件MD5值的方式，使用java.nio.file包中的Files類的靜態方法readAllBytes()讀取文件內容，然后使用java.security.MessageDigest類進行摘要計算。

import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.nio.file.Files;
import java.nio.file.Path;
import java.nio.file.Paths;
import java.security.MessageDigest;
import java.security.NoSuchAlgorithmException;
public class FileMD5 {
public static String getFileMD5(File file) throws NoSuchAlgorithmException, IOException {
MessageDigest md5Digest = MessageDigest.getInstance("MD5");
Path filePath = Paths.get(file.getAbsolutePath());
byte[] fileBytes = Files.readAllBytes(filePath);
byte[] digest = md5Digest.digest(fileBytes);
StringBuilder sb = new StringBuilder();
for (byte b : digest) {
sb.append(String.format("%02x", b));
}
return sb.toString();
}
}

這些方法都可以獲取文件的MD5值，可以根據具體的需求選擇適合的方法。