在Spring Boot中使用多個數據庫的配置方法有以下幾種：
使用多個數據源配置：可以在application.properties文件中配置多個數據源的連接參數，并使用@Configuration和@Bean注解創建對應的DataSource和JdbcTemplate bean。然后可以在需要使用的地方使用@Qualifier注解選擇對應的數據源。
使用多個JdbcTemplate配置：可以在application.properties文件中配置多個數據源的連接參數，并使用@Configuration和@Bean注解創建對應的DataSource和JdbcTemplate bean，分別為每個數據源創建不同的JdbcTemplate實例。然后可以在需要使用的地方使用@Autowired注解注入對應的JdbcTemplate。
使用Spring Data JPA的多數據源配置：可以在application.properties文件中配置多個數據源的連接參數，并使用@Configuration和@EnableJpaRepositories注解創建對應的EntityManagerFactory和TransactionManager。然后可以在需要使用的地方使用@PersistenceContext注解注入對應的EntityManager。
使用第三方庫：還可以使用第三方庫來實現多數據源配置，比如HikariCP、Druid等。這些庫提供了更強大和靈活的配置選項，可以滿足更復雜的多數據源需求。
需要注意的是，無論使用哪種方法，都需要在application.properties文件中配置對應的數據源連接參數，并將相應的依賴添加到pom.xml文件中。
