Java處理二進制文件的一般流程如下：

1. 打開文件：使用FileInputStream或者FileOutputStream類打開需要處理的二進制文件。可以使用構造函數指定文件路徑。
2. 讀取或寫入數據：使用read()方法讀取二進制文件中的數據，或者使用write()方法將數據寫入到二進制文件中。可以使用字節數組作為緩沖區來提高讀取或寫入的效率。
3. 處理數據：對讀取的數據進行處理，或者準備要寫入的數據。
4. 關閉文件：使用close()方法關閉文件流，釋放資源。

以下是一個讀取二進制文件的示例代碼：

import java.io.FileInputStream;
import java.io.IOException;

public class BinaryFileReader {
    public static void main(String[] args) {
        try {
            // 打開文件
            FileInputStream fileInputStream = new FileInputStream("binaryFile.bin");

            // 讀取數據
            byte[] buffer = new byte[1024]; // 緩沖區
            int bytesRead;
            while ((bytesRead = fileInputStream.read(buffer)) != -1) {
                // 處理數據
                for (int i = 0; i < bytesRead; i++) {
                    // 處理buffer中的數據
                    System.out.println(buffer[i]);
                }
            }

            // 關閉文件
            fileInputStream.close();
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

這個示例代碼使用FileInputStream打開一個名為"binaryFile.bin"的二進制文件，然后使用read()方法讀取文件中的數據，并對數據進行處理。最后使用close()方法關閉文件流。