Ovito是一款功能強大的原子分子可視化及分析軟件，它支持在Linux系統中進行界面操作。以下是在Linux中使用Ovito進行界面操作的基本步驟和一些高級技巧：
安裝Ovito
- 在Linux系統中，首先需要下載Ovito的安裝包。對于Ubuntu系統，可以從OVITO官網下載適合Linux版本的安裝包。
- 下載完成后，解壓安裝包，并雙擊bin文件夾中的ovito可執行文件以運行Ovito。
- 如果遇到權限問題，可以在命令前加上sudo。
界面操作基本步驟
- 打開Ovito后，可以直接拖入LAMMPS的data輸入文件或dump輸出文件等，Ovito將顯示模型。
- Ovito支持多種分析功能，如Modifier分析和Pipeline分析，可以通過界面上的工具進行操作。
- 進行空間平均作圖等高級操作，可以通過界面上的Compute Property選項進行。
Ovito在Linux中的并行計算
- Ovito支持在Linux中進行并行計算，可以通過命令行參數指定線程數來優化計算效率。
- 例如，使用
ovitos --nthreads 40 test.py命令可以指定使用40個線程進行計算。
Ovito的高級功能
- Ovito支持空間平均作圖，可以通過界面上的Compute Property選項和Color Coding功能實現，使原子應力云圖分布更加均勻和美觀。
- Ovito還支持遠程調用集群上的原子構型文件，可以在HPC Studio可視化平臺上直接使用OVITO進行快速查看。
通過上述步驟，你可以在Linux系統中高效地使用Ovito進行原子分子可視化及分析。如果你需要更詳細的使用指南或遇到問題，可以參考Ovito的官方文檔或社區論壇。
