清理MongoDB數據庫可以采取以下幾種方法：
刪除集合（Collection）或文檔（Document）：可以通過刪除不再需要的集合或文檔來清理數據庫。可以使用db.collection.drop()方法刪除集合，或者使用db.collection.remove()方法刪除文檔。
刪除索引（Index）：索引可以占據大量的存儲空間，因此刪除不再使用的索引可以幫助清理數據庫。可以使用db.collection.dropIndex()方法刪除索引。
壓縮數據庫：MongoDB在刪除文檔后不會立即釋放磁盤空間，而是將空閑空間保留在數據庫文件中。可以使用compact命令來壓縮數據庫，釋放未使用的空間。例如，可以使用db.runCommand({ compact: 'collectionName' })命令來壓縮集合。
數據歸檔和轉移：如果數據庫中包含大量歷史數據或不再使用的數據，可以考慮將這些數據歸檔到其他存儲介質，或者轉移到其他數據庫中。這樣可以減少數據庫的大小和負載。
使用TTL索引自動刪除過期數據：可以使用TTL（Time-To-Live）索引來自動刪除過期數據。TTL索引會根據指定的時間字段自動刪除超過指定時間的文檔。可以使用db.collection.createIndex()方法創建TTL索引，并設置合適的過期時間。
數據庫備份和恢復：備份數據庫并在需要時進行恢復可以清理數據庫并保護數據。通過定期備份數據庫，可以清理不再需要的數據，并在需要時恢復數據庫。
請注意，在清理數據庫之前，請確保已經進行了適當的備份，并仔細評估和確認要刪除的數據，以避免不可逆的數據損失。
