國內服務器備案的缺點有：1、流程復雜，且需要大量的時間，阻礙國內IDC公司的競爭發展；2、可能被國外勢力做文章，造成國內網絡審查、言論自由等不良影響。
具體內容如下：
1、阻礙國內IDC公司的競爭
在國內的網站都必須備案，而網站主機由一家IDC公司轉移到另一極IDC公司也需要備案才行，流程非常復雜，而網站備案需要大量的時間一般需要花20多天，有的甚至是1-2個月。所以用戶不愿意更換網站主機提供商，不愿意更換IDC公司，使得國內IDC行業沒有得到充分的競爭發展。
2、備案影響國際形象
世界200多個國家和地區，僅中國有網站備案制度，這個可能被國外勢力做文章，造成中國網絡審查、中國言論自由等問題的不良影響，影響到中國的國際形象，損害中國國家利益。
